Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USF2Q15853 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USF2Q15853 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USF2Q15853 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USF2Q15853 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USF2Q15853 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USF2Q15853 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USF2Q15853 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USF2Q15853 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USF2Q15853 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USF2Q15853 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USF2Q15853 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USF2Q15853 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USF2Q15853 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USF2Q15853 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USF2Q15853 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USF2Q15853 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USF2Q15853 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USF2Q15853 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USF2Q15853 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USF2Q15853 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USF2Q15853 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USF2Q15853 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USF2Q15853 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USF2Q15853 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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