Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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