Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRADDQ15628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRADDQ15628 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRADDQ15628 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRADDQ15628 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms