Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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