Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC3Q15034 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC3Q15034 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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