Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAPTM4AQ15012 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAPTM4AQ15012 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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