Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39AQ14964 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB39AQ14964 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB39AQ14964 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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