Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHD4Q14839 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHD4Q14839 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHD4Q14839 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
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