Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FHL3Q13643 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms