Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR3Q13615 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR3Q13615 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR3Q13615 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR3Q13615 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms