Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms