Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX3Q13185 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX3Q13185 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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