Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA1Q13131 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA1Q13131 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA1Q13131 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms