Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT88Q13099 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT88Q13099 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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