Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPTFQ12830 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPTFQ12830 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPTFQ12830 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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