Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 DPH5YLR172C 903 nt7.88□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 CTF3YLR381W 2202 nt7.87□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 AQR1YNL065W 1761 nt7.87□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 YHR033WYHR033W 1272 nt7.85□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 AOS1YPR180W 1044 nt7.85□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 DPM1YPR183W 804 nt7.85□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 KTR4YBR199W 1395 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 TUB1YML085C 1344 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 CMK2YOL016C 1344 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 YJL213WYJL213W 996 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 HOC1YJR075W 1191 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 AVO2YMR068W 1281 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 ATO2YNR002C 849 nt7.84□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 OPI1YHL020C 1215 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 HAM1YJR069C 594 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 LIA1YJR070C 978 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YOL046CYOL046C 675 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 RSC9YML127W 1746 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 RBS1YDL189W 1374 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 PDC5YLR134W 1692 nt7.83□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 COX15YER141W 1461 nt7.82□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 GPD1YDL022W 1176 nt7.82□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YLR030WYLR030W 792 nt7.82□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 FAF1YIL019W 1041 nt7.81□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 SCS22YBL091C-A 528 nt7.81□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 POB3YML069W 1659 nt7.81□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 CIT3YPR001W 1461 nt7.81□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 MTC6YHR151C 1581 nt7.8□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YEN1YER041W 2280 nt7.8□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YCL049CYCL049C 939 nt7.8□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YJL163CYJL163C 1668 nt7.79□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 QRI5YLR204W 336 nt7.79□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 NDE1YMR145C 1683 nt7.79□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YIL108WYIL108W 2091 nt7.79□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YKR018CYKR018C 2178 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 RUP1YOR138C 2016 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YKL153WYKL153W 510 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 DAL80YKR034W 810 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 CCW12YLR110C 402 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 YPR130CYPR130C 408 nt7.78□□□□□ -1.16
RTP1Q12751 CIT2YCR005C 1383 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 ELP6YMR312W 822 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 GET4YOR164C 939 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YPR076WYPR076W 375 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YPC1YBR183W 951 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 BDS1YOL164W 1941 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 GFA1YKL104C 2154 nt7.77□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 PEX28YHR150W 1740 nt7.76□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 IMD1YAR073W 1212 nt7.76□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 SSC1YJR045C 1965 nt7.76□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 CIR2YOR356W 1896 nt7.76□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 TPO1YLL028W 1761 nt7.76□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 MAK32YCR019W 1092 nt7.75□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 MRPL35YDR322W 1104 nt7.75□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 COG1YGL223C 1254 nt7.75□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 CDA1YLR307W 906 nt7.75□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.75□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 CIA1YDR267C 993 nt7.74□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 SHO1YER118C 1104 nt7.74□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 AGX1YFL030W 1158 nt7.74□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 MDH1YKL085W 1005 nt7.74□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 MPE1YKL059C 1326 nt7.74□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 EHD3YDR036C 1503 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 RTC4YNL254C 1206 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 FIT2YOR382W 462 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 SEC24YIL109C 2781 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 SMC5YOL034W 3282 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YPL277CYPL277C 1464 nt7.73□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 PPH21YDL134C 1110 nt7.72□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 YDR215CYDR215C 414 nt7.72□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 CKB1YGL019W 837 nt7.72□□□□□ -1.17
RTP1Q12751 FYV1YDR024W 486 nt7.71□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 YER137CYER137C 447 nt7.71□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 AVL9YLR114C 2295 nt7.71□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 PRB1YEL060C 1908 nt7.7□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 IMG1YCR046C 510 nt7.7□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 PET10YKR046C 852 nt7.7□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 YBR226CYBR226C 411 nt7.7□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 MAL31YBR298C 1845 nt7.7□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 BNA3YJL060W 1335 nt7.69□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 GNA1YFL017C 480 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 SNA3YJL151C 402 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 ERV25YML012W 636 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 MRPL19YNL185C 477 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 HTZ1YOL012C 405 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 YNL040WYNL040W 1371 nt7.68□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 YDR387CYDR387C 1668 nt7.67□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 RMA1YKL132C 1293 nt7.67□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 SNU71YGR013W 1863 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 FMP40YPL222W 2067 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 CDC16YKL022C 2523 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 ASR1YPR093C 867 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 TOD6YBL054W 1578 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 PLB2YMR006C 2121 nt7.66□□□□□ -1.18
RTP1Q12751 YBL113CYBL113C 2379 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 HXT13YEL069C 1695 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 APE4YHR113W 1473 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 CDC13YDL220C 2775 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 LCL3YGL085W 825 nt7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms