Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
APOBRQ0VD83 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBRQ0VD83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms