Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DHX9Q08211 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX9Q08211 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX9Q08211 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms