Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
COL16A1Q07092 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COL16A1Q07092 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL16A1Q07092 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL16A1Q07092 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms