Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREMQ03060 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREMQ03060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CREMQ03060 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREMQ03060 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREMQ03060 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREMQ03060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREMQ03060 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREMQ03060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms