Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BDH1Q02338 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BDH1Q02338 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BDH1Q02338 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms