Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIBQ01892 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIBQ01892 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIBQ01892 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIBQ01892 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms