Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPTBN1Q01082 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN1Q01082 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms