Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCCQ00597 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCCQ00597 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FANCCQ00597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms