Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPCAP84074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAP84074 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAP84074 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAP84074 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAP84074 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAP84074 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAP84074 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAP84074 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAP84074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPCAP84074 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAP84074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAP84074 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAP84074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAP84074 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAP84074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAP84074 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAP84074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAP84074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAP84074 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAP84074 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAP84074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAP84074 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAP84074 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAP84074 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAP84074 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAP84074 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAP84074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAP84074 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAP84074 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAP84074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAP84074 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAP84074 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAP84074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAP84074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAP84074 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAP84074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAP84074 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAP84074 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAP84074 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAP84074 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAP84074 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAP84074 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPCAP84074 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPCAP84074 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPCAP84074 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAP84074 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAP84074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAP84074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAP84074 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAP84074 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms