Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX4P78413 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX4P78413 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX4P78413 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX4P78413 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX4P78413 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX4P78413 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX4P78413 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX4P78413 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX4P78413 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX4P78413 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX4P78413 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX4P78413 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX4P78413 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX4P78413 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX4P78413 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX4P78413 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX4P78413 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX4P78413 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX4P78413 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX4P78413 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX4P78413 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX4P78413 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX4P78413 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX4P78413 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX4P78413 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX4P78413 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX4P78413 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX4P78413 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX4P78413 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX4P78413 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX4P78413 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX4P78413 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX4P78413 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX4P78413 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX4P78413 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX4P78413 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX4P78413 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms