Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4AP68366 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4AP68366 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4AP68366 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms