Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM258P61165 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms