Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN1P60606 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN1P60606 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN1P60606 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms