Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBASH3AP57075 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBASH3AP57075 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBASH3AP57075 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms