Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3BP55884 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3BP55884 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms