Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A2P55011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A2P55011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A2P55011 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms