Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MVDP53602 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVDP53602 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVDP53602 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVDP53602 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVDP53602 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVDP53602 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVDP53602 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVDP53602 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVDP53602 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVDP53602 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVDP53602 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVDP53602 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MVDP53602 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MVDP53602 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVDP53602 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVDP53602 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVDP53602 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVDP53602 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVDP53602 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVDP53602 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVDP53602 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVDP53602 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVDP53602 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVDP53602 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVDP53602 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVDP53602 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVDP53602 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVDP53602 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVDP53602 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MVDP53602 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVDP53602 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVDP53602 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVDP53602 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVDP53602 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVDP53602 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVDP53602 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVDP53602 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVDP53602 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVDP53602 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MVDP53602 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVDP53602 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVDP53602 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVDP53602 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVDP53602 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVDP53602 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MVDP53602 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MVDP53602 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVDP53602 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVDP53602 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVDP53602 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVDP53602 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVDP53602 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVDP53602 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVDP53602 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MVDP53602 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVDP53602 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVDP53602 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVDP53602 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MVDP53602 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVDP53602 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVDP53602 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVDP53602 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVDP53602 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MVDP53602 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MVDP53602 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MVDP53602 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVDP53602 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVDP53602 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVDP53602 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVDP53602 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVDP53602 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVDP53602 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVDP53602 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms