Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.47■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA2P51531 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC45.42■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
SMARCA2P51531 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SMARCA2P51531 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.84
SMARCA2P51531 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC45.25■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
SMARCA2P51531 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms