Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4BP51164 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4BP51164 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4BP51164 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4BP51164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms