Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT3P49368 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT3P49368 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT3P49368 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT3P49368 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT3P49368 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT3P49368 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT3P49368 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT3P49368 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT3P49368 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT3P49368 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT3P49368 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT3P49368 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT3P49368 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT3P49368 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT3P49368 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT3P49368 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT3P49368 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT3P49368 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT3P49368 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT3P49368 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT3P49368 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT3P49368 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT3P49368 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT3P49368 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT3P49368 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT3P49368 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT3P49368 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT3P49368 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT3P49368 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT3P49368 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT3P49368 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT3P49368 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT3P49368 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT3P49368 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT3P49368 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT3P49368 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT3P49368 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT3P49368 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT3P49368 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT3P49368 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT3P49368 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT3P49368 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT3P49368 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT3P49368 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT3P49368 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT3P49368 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT3P49368 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT3P49368 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT3P49368 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT3P49368 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT3P49368 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms