Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPIAP49247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPIAP49247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPIAP49247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPIAP49247 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPIAP49247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPIAP49247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPIAP49247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPIAP49247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPIAP49247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPIAP49247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPIAP49247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPIAP49247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPIAP49247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPIAP49247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPIAP49247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPIAP49247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPIAP49247 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPIAP49247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPIAP49247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPIAP49247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPIAP49247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPIAP49247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPIAP49247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPIAP49247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPIAP49247 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPIAP49247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPIAP49247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPIAP49247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPIAP49247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPIAP49247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPIAP49247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPIAP49247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPIAP49247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPIAP49247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPIAP49247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPIAP49247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPIAP49247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPIAP49247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPIAP49247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPIAP49247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPIAP49247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPIAP49247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPIAP49247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPIAP49247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPIAP49247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPIAP49247 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPIAP49247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPIAP49247 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPIAP49247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPIAP49247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPIAP49247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPIAP49247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPIAP49247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPIAP49247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPIAP49247 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPIAP49247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPIAP49247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPIAP49247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPIAP49247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPIAP49247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPIAP49247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPIAP49247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPIAP49247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms