Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms