Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1A1P48729 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1A1P48729 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms