Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRXP46100 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRXP46100 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRXP46100 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRXP46100 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRXP46100 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRXP46100 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRXP46100 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRXP46100 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRXP46100 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRXP46100 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRXP46100 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRXP46100 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRXP46100 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRXP46100 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRXP46100 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRXP46100 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRXP46100 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRXP46100 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRXP46100 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRXP46100 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRXP46100 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRXP46100 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRXP46100 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRXP46100 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRXP46100 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRXP46100 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRXP46100 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRXP46100 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRXP46100 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRXP46100 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRXP46100 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRXP46100 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRXP46100 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRXP46100 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRXP46100 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRXP46100 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRXP46100 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRXP46100 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRXP46100 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRXP46100 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRXP46100 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRXP46100 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms