Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSR1P43307 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSR1P43307 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSR1P43307 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSR1P43307 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSR1P43307 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSR1P43307 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSR1P43307 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSR1P43307 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSR1P43307 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSR1P43307 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSR1P43307 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSR1P43307 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSR1P43307 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSR1P43307 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSR1P43307 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSR1P43307 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSR1P43307 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSR1P43307 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSR1P43307 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSR1P43307 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSR1P43307 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSR1P43307 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSR1P43307 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSR1P43307 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSR1P43307 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSR1P43307 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SSR1P43307 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSR1P43307 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSR1P43307 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSR1P43307 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSR1P43307 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSR1P43307 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSR1P43307 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSR1P43307 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSR1P43307 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSR1P43307 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSR1P43307 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSR1P43307 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSR1P43307 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSR1P43307 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSR1P43307 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSR1P43307 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSR1P43307 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSR1P43307 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSR1P43307 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSR1P43307 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSR1P43307 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSR1P43307 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSR1P43307 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSR1P43307 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms