Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGIRP43119 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGIRP43119 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGIRP43119 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms