Protein–RNA interactions for Protein: P41226

UBA7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA7P41226 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBA7P41226 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UBA7P41226 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBA7P41226 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA7P41226 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBA7P41226 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBA7P41226 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBA7P41226 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBA7P41226 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA7P41226 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA7P41226 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBA7P41226 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA7P41226 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA7P41226 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBA7P41226 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBA7P41226 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBA7P41226 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBA7P41226 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBA7P41226 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBA7P41226 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBA7P41226 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBA7P41226 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA7P41226 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA7P41226 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBA7P41226 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBA7P41226 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA7P41226 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBA7P41226 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBA7P41226 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA7P41226 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA7P41226 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA7P41226 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBA7P41226 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA7P41226 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA7P41226 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA7P41226 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA7P41226 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBA7P41226 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBA7P41226 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBA7P41226 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBA7P41226 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UBA7P41226 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBA7P41226 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBA7P41226 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA7P41226 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA7P41226 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA7P41226 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA7P41226 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBA7P41226 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA7P41226 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA7P41226 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBA7P41226 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBA7P41226 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBA7P41226 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBA7P41226 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBA7P41226 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBA7P41226 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBA7P41226 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBA7P41226 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBA7P41226 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBA7P41226 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBA7P41226 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms