Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL13AP40429 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL13AP40429 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms