Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FEN1P39748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FEN1P39748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FEN1P39748 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FEN1P39748 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FEN1P39748 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FEN1P39748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FEN1P39748 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FEN1P39748 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FEN1P39748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FEN1P39748 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FEN1P39748 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FEN1P39748 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FEN1P39748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FEN1P39748 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FEN1P39748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FEN1P39748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FEN1P39748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FEN1P39748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FEN1P39748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FEN1P39748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FEN1P39748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FEN1P39748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FEN1P39748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FEN1P39748 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FEN1P39748 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FEN1P39748 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FEN1P39748 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FEN1P39748 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FEN1P39748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FEN1P39748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FEN1P39748 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FEN1P39748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FEN1P39748 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FEN1P39748 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FEN1P39748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FEN1P39748 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FEN1P39748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FEN1P39748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FEN1P39748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms