Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ZEB1P37275 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ZEB1P37275 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZEB1P37275 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
ZEB1P37275 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ZEB1P37275 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms