Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP62P37198 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP62P37198 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP62P37198 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP62P37198 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP62P37198 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP62P37198 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP62P37198 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP62P37198 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP62P37198 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP62P37198 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP62P37198 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP62P37198 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP62P37198 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP62P37198 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP62P37198 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP62P37198 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP62P37198 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP62P37198 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP62P37198 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP62P37198 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP62P37198 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP62P37198 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP62P37198 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP62P37198 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP62P37198 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP62P37198 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP62P37198 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP62P37198 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP62P37198 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP62P37198 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP62P37198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP62P37198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP62P37198 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP62P37198 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP62P37198 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP62P37198 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP62P37198 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms