Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E1P36543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E1P36543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms