Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJC1P36383 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJC1P36383 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJC1P36383 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJC1P36383 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJC1P36383 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJC1P36383 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJC1P36383 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJC1P36383 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJC1P36383 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJC1P36383 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJC1P36383 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJC1P36383 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJC1P36383 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJC1P36383 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJC1P36383 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJC1P36383 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJC1P36383 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJC1P36383 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJC1P36383 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJC1P36383 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJC1P36383 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJC1P36383 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJC1P36383 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJC1P36383 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJC1P36383 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJC1P36383 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJC1P36383 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJC1P36383 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJC1P36383 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJC1P36383 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJC1P36383 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJC1P36383 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJC1P36383 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJC1P36383 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJC1P36383 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJC1P36383 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJC1P36383 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJC1P36383 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJC1P36383 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJC1P36383 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJC1P36383 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJC1P36383 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJC1P36383 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJC1P36383 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJC1P36383 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJC1P36383 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJC1P36383 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJC1P36383 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJC1P36383 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJC1P36383 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJC1P36383 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJC1P36383 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJC1P36383 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJC1P36383 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJC1P36383 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJC1P36383 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJC1P36383 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJC1P36383 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJC1P36383 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJC1P36383 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJC1P36383 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms