Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER1P34995 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER1P34995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms