Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA3P34903 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA3P34903 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA3P34903 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms