Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSG3P32926 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSG3P32926 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSG3P32926 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSG3P32926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSG3P32926 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSG3P32926 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DSG3P32926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSG3P32926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DSG3P32926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DSG3P32926 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DSG3P32926 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSG3P32926 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DSG3P32926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DSG3P32926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSG3P32926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSG3P32926 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSG3P32926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSG3P32926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSG3P32926 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSG3P32926 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSG3P32926 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSG3P32926 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSG3P32926 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DSG3P32926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSG3P32926 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSG3P32926 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSG3P32926 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSG3P32926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSG3P32926 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSG3P32926 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSG3P32926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSG3P32926 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSG3P32926 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSG3P32926 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DSG3P32926 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSG3P32926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSG3P32926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSG3P32926 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSG3P32926 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSG3P32926 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSG3P32926 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSG3P32926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSG3P32926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSG3P32926 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DSG3P32926 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSG3P32926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSG3P32926 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSG3P32926 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DSG3P32926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSG3P32926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSG3P32926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSG3P32926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSG3P32926 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSG3P32926 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSG3P32926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSG3P32926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSG3P32926 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DSG3P32926 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSG3P32926 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSG3P32926 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSG3P32926 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DSG3P32926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSG3P32926 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSG3P32926 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DSG3P32926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSG3P32926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSG3P32926 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DSG3P32926 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DSG3P32926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms